自2002年公布第一批“中国百种优秀学术期刊”以来，《西北农林科技大学学报（自然科学版）》已11次入选。 自2013年起已连续7年获此殊荣。本次入选的100种期刊中，高校期刊仅有6种，全国农林院校期刊仅有陕西省1种。
2020年“中国百种优秀学术期刊”是根据中国科学技术情报研究所“中国科技论文与引文数据库（CSTPCD）”，在评选的1946年“中国科技核心期刊”基础上依据20余项文献计量指标，评选出中文出版的“中国优质科技期刊”300种，英文出版的“中国优质国际科技期刊”20种。 在此基础上，采用层次分析法，定性与定量相结合，采用科学计量和专家打分的方法，对112种学科期刊进行综合评价，评选出各学科类别中最重要的期刊作为优秀学术期刊，最终评选出100个“优秀学术期刊”。 2019年度100种优秀中国学术期刊》《期刊》，获评期刊集体代表了中国科技期刊各学科的最高水平。
今年，我校学报还荣获中国科学技术情报研究所“第五届中国优质科技期刊”、中国高校科技期刊研究会“中国高校优秀科技期刊”、以及陕西省科技期刊编辑协会主办的“第六届中国科技期刊编辑协会”。 被陕西省高校学报研究会评为“陕西省优秀科技期刊”、“陕西省高校优秀学报”，被编辑部评为“中国农业期刊传播力最强期刊”第一届中国农业期刊网委员会．
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